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séquençage de l'ADN et les données des patients utilisés pour stopper l'épidémie de l'infection

Les équipes cliniques et de recherche dans les hôpitaux universitaires d'Oxford (OUH) NHS Foundation Trust, en utilisant la prévention des infections et les meilleures pratiques, séquençage du génome entier et les données électroniques du patient, ont arrêté une épidémie d'un pathogène fongique potentiellement mortelle après la détection que l'équipement de patients multi-usage était responsable.

La percée à l'hôpital John Radcliffe est important que c'est la première fois une épidémie de Candida auris (C. auris) a été complètement terminée par une compréhension claire de la cause.

L'étude, publié dans le New England Journal of Medicine, a été menée par l'infection, Prévention et contrôle et Neurosciences Unité de soins intensifs (soins intensifs) équipes de OUH, l'Université de Département Nuffield de médecine d'Oxford, l'Institut Big Data et l'Unité de recherche sur la protection de la santé et de la santé publique NIHR Angleterre, et soutenu par le Centre de recherche biomédicale NIHR Oxford.

L'investigateur principal, Dr David Eyre, Chercheur en maladies infectieuses au Big Data Institute, m'a dit: «Il est très agréable que nos recherches aient conduit à la C. auris épidémie en cours d'arrêt. Il existe un certain nombre d'hôpitaux au Royaume-Uni et dans le monde qui n'ont pas été en mesure d'arrêter leurs épidémies. Déterminer comment il se transmet devrait aider à contenir sa propagation dans le monde.

"Telle est la nature de cet agent pathogène que nous devons rester vigilants, et nous sommes ravis que, depuis que nous avons changé notre approche à la suite de nos découvertes, nous n'avons plus eu de cas.’

C. auris est une émergence, agent pathogène fongique multirésistant récemment associé à des épidémies dans le monde entier, souvent dans les unités de soins intensifs. Chez certains malades, C. auris peut pénétrer dans la circulation sanguine et se propager dans tout le corps, causant une infection grave.

Les chercheurs ont étudié un grand C. auris épidémie à l’unité de soins intensifs en neurosciences de l’hôpital John Radcliffe entre 2015 et 2017, loin de 70 les patients ont été identifiés comme étant colonisés ou infectés par C. auris.

Utilisation du séquençage du génome entier des isolats de patients et environnementaux, combiné avec les données du dossier de santé électronique, ils ont étudié les voies de transmission possibles, facteurs de risque de colonisation et épidémiologie moléculaire de l'épidémie.

Les patients des soins intensifs en neurosciences ont été régulièrement dépistés pour C. auris, tout comme ceux du service de neurosciences adjacent. Des échantillons ont également été prélevés dans l'environnement, se concentrer sur l'échantillonnage des zones à fort contact et des appareils à usages multiples.

'Nous avons trouvé que C. auris a été rarement détecté dans l'environnement général; il n'y avait aucune trace de l'organisme sur les surfaces à l'intérieur de l'unité et seulement 1 hors de 16 les échantillons d'air étaient positifs,’ Le Dr Eyre a expliqué.

'Cependant, nous avons trouvé C. auris sur l'équipement patient multi-usage, notamment les sondes de température. Il y avait des correspondances génétiques étroites entre C. auris isolé des patients et de ces thermomètres. Nous avons constaté que la surveillance de leur température avec l'une de ces sondes était un facteur de risque important pour l'acquisition de C. auris. Et contrairement aux agents pathogènes comme C. difficile, la proximité du lit ne semble pas être un facteur de transmission.

«Ainsi, nos recherches ont clairement montré que la survie environnementale semble être la clé de Candida auris persistance et transmission dans les milieux de soins. Cela nous a conduit à mettre en œuvre des mesures de contrôle des infections efficaces pour contenir l'épidémie, notamment en supprimant l'utilisation des thermomètres multi-usages pour la surface de la peau.,’ il a dit.

Professeur Derrick Crook, Directeur du National Infection Service à Public Health England et responsable du thème de la résistance aux antimicrobiens au NIHR Oxford Biomedical Research Center, m'a dit: «Cette étude alimentera directement les directives de santé concernant l'utilisation d'équipements à usages multiples, et notamment la décontamination de ces équipements en cas de futures épidémies.

«Bien qu'un nombre relativement restreint de patients de l'étude d'Oxford aient eu une C. auris infections, de telles infections peuvent avoir de graves conséquences pour le type de patients vulnérables admis dans les unités de soins intensifs, particulièrement comme C. auris est très résistant à de nombreux agents antifongiques. Les mesures prises à la suite de cette recherche ont sans aucun doute empêché davantage de patients d'être colonisés et infectés.’


La source:

http://www.ox.ac.uk/news

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