Sequenziamento del DNA e dati dei pazienti utilizzati per arrestare lo scoppio dell'infezione

La svolta al John Radcliffe Hospital è significativa in quanto questa è la prima volta che si verifica un focolaio di Orecchie bianche (C. auris) è stato completamente concluso con una chiara comprensione della causa.

Lo studio, pubblicato sul New England Journal of Medicine, è stato condotto dall'infezione, Unità di Terapia Intensiva Prevenzione e Controllo e Neuroscienze (terapia intensiva) squadre di OUH, del Nuffield Department of Medicine dell'Università di Oxford, il Big Data Institute e l'Unità di ricerca sulla protezione della salute del NIHR e la sanità pubblica in Inghilterra, e supportato dal NIHR Oxford Biomedical Research Center.

L'investigatore capo, Il dottor David Eyre, Research Fellow in Malattie Infettive presso il Big Data Institute, disse: “È molto piacevole che la nostra ricerca abbia portato alla C. auris l'epidemia viene fermata. Ci sono un certo numero di ospedali nel Regno Unito e in tutto il mondo che non sono stati in grado di fermare i loro focolai. Capire come si trasmette dovrebbe aiutare a contenerne la diffusione in tutto il mondo.

“Tale è la natura di questo agente patogeno che dobbiamo rimanere vigili, e ne siamo felicissimi, da quando abbiamo cambiato il nostro approccio a seguito delle nostre scoperte, non abbiamo avuto ulteriori casi.’

C. auris è un emergente, patogeno fungino resistente a più farmaci recentemente associato a focolai in tutto il mondo, spesso in unità di terapia intensiva. In alcuni pazienti, C. auris può entrare nel flusso sanguigno e diffondersi in tutto il corpo, provocando una grave infezione.

I ricercatori hanno studiato un grande C. auris focolaio al John Radcliffe Hospital's Neurosciences ICU tra 2015 e 2017, durante il quale 70 i pazienti sono stati identificati come colonizzati o infetti C. auris.

Utilizzo del sequenziamento dell'intero genoma di isolati di pazienti e ambientali, combinato con i dati del fascicolo sanitario elettronico, hanno studiato le possibili vie di trasmissione, fattori di rischio per la colonizzazione e l'epidemiologia molecolare dell'epidemia.

I pazienti in terapia intensiva di neuroscienze sono stati regolarmente sottoposti a screening C. auris, così come quelli dell'adiacente reparto di Neuroscienze. I campioni sono stati prelevati anche dall'ambiente, concentrandosi sul campionamento di aree high-touch e dispositivi multiuso.

'L'abbiamo trovato C. auris è stato raramente rilevato nell'ambiente generale; non c'era traccia dell'organismo sulle superfici all'interno dell'unità e solo 1 fuori da 16 i campioni d'aria sono risultati positivi,’ ha spiegato il dottor Eyre.

'Tuttavia, abbiamo trovato C. auris su apparecchiature paziente multiuso, in particolare sonde di temperatura. C'erano strette corrispondenze genetiche tra di loro C. auris isolati dai pazienti e da questi termometri. Abbiamo scoperto che avere la loro temperatura monitorata con una di queste sonde era un importante fattore di rischio per l'acquisizione di C. auris. E a differenza di agenti patogeni come C. difficile, la vicinanza del letto non sembra essere un fattore di trasmissione.

“Quindi la nostra ricerca ha mostrato chiaramente che la sopravvivenza ambientale sembra essere la chiave per Candida auris persistenza e trasmissione in ambito sanitario. Ciò ci ha portato a implementare efficaci misure di controllo delle infezioni per contenere l'epidemia, inclusa la rimozione dall'uso dei termometri multiuso per la superficie cutanea,’ Egli ha detto.

Professor Derrick Crook, Direttore del National Infection Service presso Public Health England e responsabile del tema della resistenza antimicrobica presso il NIHR Oxford Biomedical Research Center, disse: “Questo studio alimenterà direttamente le linee guida sanitarie riguardanti l'uso di apparecchiature multiuso, e in particolare la decontaminazione di queste apparecchiature in caso di future epidemie.

“Anche se un numero relativamente piccolo di pazienti nello studio di Oxford ha avuto risultati clinicamente significativi C. auris infezioni, tali infezioni possono avere gravi conseguenze per il tipo di pazienti vulnerabili ricoverati nelle unità di terapia intensiva, particolarmente come C. auris è altamente resistente a molti agenti antimicotici. L'azione intrapresa come risultato di questa ricerca ha indubbiamente evitato che più pazienti venissero colonizzati e infettati.’

fonte:

http://www.ox.ac.uk/news