A disseminação de células cancerosas determinados com o novo modelo desenvolvido na YSPH

Pesquisadores da Escola Yale de Saúde Pública descobriram uma relação matemática que lança nova luz sobre a taxa na qual as células cancerosas e mutação, por que alguns sobrevivem e se multiplicam rapidamente, ainda outros não.

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A descoberta pelos membros do laboratório de Jeffrey Townsend, Ph.D., o professor Elihu de Bioestatística e de Ecologia e Biologia Evolutiva, permitirá que os cálculos essenciais a serem executadas que determinam o alcance provável de células cancerosas como elas se desenvolvem.

A descoberta tem implicações para a tomada de decisões para placas tumorais precisão-medicina, a seleção e concepção dos ensaios clínicos, o desenvolvimento de produtos farmacêuticos e priorização de pesquisa básica.

O estudo está publicado no Journal of the National Cancer Institute.

"Para o passado 10 anos temos sido capazes de calcular a partir sequenciamento tumor que genes mutantes são vencedores e perdedores-que mutantes genes ajudar o câncer de sobreviver e se reproduzir, e que não fazer nada,”Townsend disse. “Mas não temos sido capazes de calcular a sua tamanho do efeito cancro-como importante uma mutação é comparada com outra. Agora nós podemos “.

Um dos principais objetivos da biologia do câncer é a de não apenas identificar os genes importantes e sem importância para o desenvolvimento do câncer, mas para determinar a importância relativa de cada mutação celular para a sobrevivência e a propagação de células de cancro e, em última análise, o que significa para o paciente, Townsend explicou.

No estudo, os investigadores estimaram os tamanhos dos efeitos de todas as variantes de um único nucleótido no recorrentes 22 principais tipos de câncer, e quantificada a importância relativa de cada.

estudos de sequenciação de tumor têm tipicamente relatada como mutações frequentes são vistos e uma medida estatística (uma P valor) indica se o gene está sobrecarregado com mutações além das expectativas, as duas medidas importantes. Contudo, nem medida é um tamanho de efeito para o câncer. Nem medida comunica o quão importante é o gene para a tumorigese e cancro da doença. Para quantificar o câncer tamanho do efeito, Townsend e colegas quebrou a frequência que uma mutação é observada em tumores em dois factores que contribuem: the baseline mutation rate, and the degree of selection for the mutation in the cancer lineage. Both mutation and selection contribute to the frequency of variants among cells. Townsend and colleagues were able to use diverse genome-scale data to calculate the mutation rate. By essentially dividing out the contribution of mutation from the frequency that mutations were observed in tumors, they showed how to calculate the cancer effect size

credita Townsend a descoberta de insights que vêm de ter um fundo na biologia evolutiva. “Considerando que, no mundo do câncer, o foco tem sido sempre em taxas de mutação, o foco na biologia evolutiva tem sido no processo de seleção natural sobre essas mutações. A quantificação dos tamanhos do efeito câncer é um grande exemplo de pesquisa interdisciplinar como não só é útil, mas essencial ao progresso científico," ele disse.

Porque é que o tamanho do efeito câncer importante? Townsend usa um exemplo de um tumor, a partir do qual uma sequência de ADN que mostra que dois genes que se sabe estarem relacionados com o cancro ter mutado. Há dois medicamentos altamente eficazes que visem estas mutações exatas, mas nenhum ensaio clínico foi conduzido para compará-los.

“Ao olhar para o câncer através da lente da evolução podemos aproveitar a riqueza de dados moleculares disponibilizados através sequenciamento de DNA do tumor tanto para entender melhor o que está dirigindo o câncer e também para expandir e refinar a teoria da evolução,”Disse Vincent Cannataro, Ph.D., um associado de pós-doutorado e primeiro autor do estudo.

O estudo foi co-autoria de Stephen Gaffney, Ph.D., um pesquisador associado na Yale School of Public Health. A pesquisa foi financiada por uma subvenção da Gilead Sciences, Inc.

Fonte: publichealth.yale.edu, por Elisabeth Reitman