新的模型来确定癌细胞在YSPH开发的蔓延

在公共卫生耶鲁大学研究人员发现，在上其癌细胞发生变异，为什么有的生存和繁殖迅速的速度揭示新的光的数学关系, 但别人不一样.

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杰弗里·汤森的实验室成员发现, 博士, 生物统计学的教授以利户和生态学和进化生物学, 将允许进行必要的计算方法，确定癌细胞的可能范围，因为他们发展.

这一发现对精度医药肿瘤板对决策的影响, 选择和临床试验的设计, 药品和基础研究优先发展.

这项研究发表在国家癌症研究所.

“在过去的 10 多年来，我们已经能够从突变基因是赢家和输家，它的突变基因有助于得癌症的生存和繁殖的肿瘤测序来计算, 和什么也不做,”汤森说. “但我们一直无法计算它们 癌作用大小 - 如何重要的一个突变相比，另一. 现在，我们可以“。

癌症生物学的一个主要目标是不仅是识别重要的和不重要的基因，癌症的发展, 但要确定每个细胞突变生存的相对重要性和传播的癌细胞和, 最终, 这意味着什么对患者, 汤森解释.

在这项研究中, 研究人员估计所有经常单核苷酸变异的影响大小的 22 主要类型的癌症, 和量化每个的相对重要性.

肿瘤测序研究通常报道的突变如何频繁被看见和统计指标 (一个 P 值) 表明基因是否负担过重超出预期的突变, 这两个重要措施. 然而, 既不措施是用于癌症的效果大小. 无论是测量通信的基因如何重要的是肿瘤和癌症疾病. 为了量化癌作用大小, 汤森和同事们打破了该突变在肿瘤中观察到的频率为两个影响因素: 基线变异率, 和选择的程度在癌症细胞系的基因突变. 这两种变异和选择有助于变种小区中的频率. 汤森和他的同事们能够使用不同的基因组大规模数据计算的突变率. 基本上通过将除突变的，来自于肿瘤中观察到的突变频率的贡献, 他们表现如何计算癌症效果大小

汤森归功于突破的见解，来自其在进化生物学背景. “而在世界上的癌症将重点一直在变异率, 在进化生物学重点是对那些突变的自然选择的过程. 癌症效果大小的量化是如何跨学科研究的一个很好的例子，不仅有利于, 但重要的科学进展,“ 他说.

为什么癌症影响的大小很重要? 汤森使用肿瘤的例子, 从其中的DNA序列示出了已知的与癌症相关的两个基因已突变的. 有两个非常有效的药物，针对这些具体的突变，但没有临床试验已进行了对它们进行比较.

“通过在进化镜头看癌症，我们可以通过利用肿瘤DNA测序可以在两个分子的大量数据更好地理解什么是推动癌症和也扩展和优化进化论,”文森特说Cannataro, 博士, 一个博士后和研究的第一作者.

由斯蒂芬·加夫尼这项研究是共同撰写, 博士, 在公共卫生耶鲁大学的副研究员. 该研究由吉利德科学基金资助项目, 公司.

资源: publichealth.yale.edu, 伊丽莎白·雷特曼