Die Ausbreitung von Krebszellen mit neuem Modell bei YSPH entwickelt bestimmt

Forscher an der Yale School of Public Health haben eine mathematische Beziehung entdeckt, die auf die Geschwindigkeit ein neues Licht wirft, bei der Krebszellen mutieren und warum einige überleben und sich schnell vermehren, noch andere dies nicht tun.

Photo credit: iStock

Die Entdeckung von Mitgliedern des Labors von Jeffrey Townsend, Ph.D., der Elihu Professor für Biostatistik und der Ökologie und Evolutionsbiologie, ermöglicht wesentliche Berechnungen durchgeführt werden, dass der wahrscheinliche Umfang von Krebszellen zu bestimmen, wie sie sich entwickeln.

Die Feststellung hat Auswirkungen auf die Entscheidungsfindung für präzisions Medizin Tumorboards, die Auswahl und Gestaltung von klinischen Studien, die Entwicklung von Arzneimitteln und Grundlagenforschung Priorisierung.

Die Studie ist im Journal des National Cancer Institute veröffentlicht.

"Für die Vergangenheit 10 Jahren konnten wir aus Tumor Sequenzierung berechnen, die der Krebs mutierten Gene Gewinner und Verlierer-welche Gene mutiert helfen, überleben und reproduzieren, und die nichts zu tun,“Townsend, sagte. „Aber wir haben nicht in der Lage, ihre zu berechnen Krebs-Wirkung Größe-Wie wichtig eine Mutation zu einem anderen verglichen. Jetzt können wir."

Ein wichtiges Ziel der Krebsbiologie ist es, nicht nur die wichtigen und unwichtigen Gene für die Entwicklung von Krebs zu identifizieren, aber die relative Wichtigkeit jeder zellulären Mutation für das Überleben und die Ausbreitung von Krebszellen zu bestimmen, und, letzten Endes, was es bedeutet für die Patienten, Townsend erklärt.

In der Studie, Die Forscher schätzten die Effektgrößen aller rezidivierenden Einzel-Nukleotid-Varianten in 22 wichtigste Arten von Krebs, und quantifiziert, um die relative Bedeutung jedes.

Tumor-Sequenzierung Studien haben in der Regel berichtet, wie häufige Mutationen sind zu sehen und ein statistisches Maß (ein P Wert) angibt, ob das Gen mit Mutationen über Erwarten überfrachtet wird,, beide wichtige Maßnahmen. jedoch, weder Maßnahme ist eine Effektgröße für Krebs. Weder Maßnahme in Verbindung steht, wie wichtig das Gen an der Tumorentstehung und Krebserkrankung ist. Krebs-Wirkung Größe zu quantifizieren, Townsend und Kollegen brachen die Frequenz nach unten, die eine Mutation in Tumoren in zwei Faktoren beobachtet wird: die Basislinie Mutationsrate, und der Grad der Auswahl für die Mutation in der Krebs-Linie. Sowohl Mutation und Selektion tragen zur Häufigkeit von Varianten unter den Zellen. Townsend und seine Kollegen konnten diverse genomweite Daten verwenden, um die Mutationsrate zu berechnen. Durch im Wesentlichen den Beitrag der Mutation von dem Frequenzteilungs heraus, dass Mutationen in Tumoren beobachtet wurden, sie zeigten, wie die Krebs-Wirkung Größe berechnen

Townsend schreibt den Durchbruch zu Erkenntnissen, die aus mit einem Hintergrund in der Evolutionsbiologie kommen. „Während in der Krebs Welt hat sich der Fokus auf Mutationsraten immer, der Schwerpunkt in der Evolutionsbiologie hat sich auf diesen Mutationen auf den Prozess der natürlichen Selektion gewesen. Die Quantifizierung von Krebseffektgrößen ist ein gutes Beispiel dafür, wie die interdisziplinären Forschung ist nicht nur hilfreich, aber wesentlich zum wissenschaftlichen Fortschritt," er sagte.

Warum ist die Krebs-Wirkung Größe wichtig? Townsend nutzt ein Beispiel eines Tumors, aus denen zeigt eine DNA-Sequenz, dass zwei zu Krebs bekannten Gene mutiert werden verwandte. Es gibt zwei hochwirksame Medikamente genau diese Mutationen Targeting aber keine klinische Studie durchgeführt wurde, um sie zu vergleichen.

„Durch die bei Krebs durch die Linse der Evolution suchen, können wir den Reichtum der molekularen Daten nutzen, durch Tumor-DNA-Sequenzierung, um sowohl besser zugänglich gemacht zu verstehen, was Krebs fährt und auch zu erweitern und die Evolutionstheorie verfeinern,“Sagte Vincent Cannataro, Ph.D., Postdoc und Erstautor der Studie.

Die Studie wurde Co-Autor von Stephen Gaffney, Ph.D., ein assoziierte Wissenschaftler an der Yale School of Public Health. Die Forschung wurde unterstützt durch einen Zuschuss von Gilead Sciences finanziert, Inc.

Quelle: publichealth.yale.edu, von Elisabeth Reitman