Ein encertificial Intelligence System beschleunigt die Suche nach Krebsentdeckungen

Suche durch die Berge von veröffentlichte Krebsforschung Wissenschaftlern erleichtert werden könnte, dank eines neuen Systems der künstlichen Intelligenz. Das System, LION LBD genannt und von Informatikern und Krebsforschern der University of Cambridge entwickelt, wurde entwickelt, um Wissenschaftler bei der Suche nach krebsbezogenen Entdeckungen zu unterstützen. Es ist das erste literaturbasierte Entdeckungssystem zur Unterstützung der Krebsforschung. Die Ergebnisse werden in der Zeitschrift veröffentlicht Bioinformatik.

Die globale Krebsforschung zieht weltweit enorme Summen an Finanzmitteln an, und die wissenschaftliche Literatur ist mittlerweile so umfangreich, dass Forscher Mühe haben, damit Schritt zu halten: kritische hypothesengenerierende Beweise werden heute oft lange nach ihrer Veröffentlichung entdeckt.

Krebs ist eine komplexe Klasse von Krankheiten, die nicht vollständig verstanden werden und weltweit die zweithäufigste Todesursache sind. Die Krebsentstehung beinhaltet Veränderungen in zahlreichen chemischen und biochemischen Molekülen, Reaktionen und Wege, und Krebsforschung wird in einer Vielzahl von wissenschaftlichen Bereichen durchgeführt, die eine Variabilität in der Art und Weise haben, wie sie ähnliche Konzepte beschreiben.

“Als Krebsforscher, auch wenn Sie wüssten, wonach Sie suchen, Jeden Tag erscheinen buchstäblich Tausende von Zeitungen,” sagte Professorin Anna Korhonen, Co-Direktor des Language Technology Lab von Cambridge, der die Entwicklung von LION LBD in Zusammenarbeit mit Dr. Masashi Narita vom Cancer Research UK Cambridge Institute und Professor Ulla Stenius vom Karolinska Institutet in Schweden leitete. “LION LBD nutzt KI, um Wissenschaftler dabei zu unterstützen, über veröffentlichte Entdeckungen auf ihrem Gebiet auf dem Laufenden zu bleiben, könnte ihnen aber auch dabei helfen, neue Entdeckungen zu machen, indem sie kombinieren, was bereits in der Literatur bekannt ist, indem Verbindungen zwischen Quellen hergestellt werden, die scheinbar keinen Bezug zueinander haben.”

Die „LBD’ in LION LBD steht für Literature-Based Discovery, ein in den 1980er Jahren entwickeltes Konzept, das darauf abzielt, neue Entdeckungen zu machen, indem es Informationen aus getrennten Quellen durchkämmt. Die Schlüsselidee hinter der ursprünglichen Version von LBD ist, dass Konzepte, die in der Literatur nie explizit verknüpft sind, indirekt durch Zwischenkonzepte verknüpft werden können.

Das Design des LION LBD-Systems ermöglicht eine Echtzeitsuche, um indirekte Assoziationen zwischen Entitäten in einer Datenbank mit mehreren zehn Millionen Veröffentlichungen zu entdecken, während die Fähigkeit der Benutzer erhalten bleibt, jede Erwähnung in ihrem ursprünglichen Kontext zu untersuchen.

“Beispielsweise, Sie wissen vielleicht, dass ein Krebsmedikament das Verhalten eines bestimmten Signalwegs beeinflusst, aber mit LION LBD, Möglicherweise stellen Sie fest, dass ein Medikament, das für eine völlig andere Krankheit entwickelt wurde, denselben Signalweg beeinflusst,” sagte Korhonen.

LION LBD ist das erste System, das speziell für die Bedürfnisse der Krebsforschung entwickelt wurde. Es hat einen besonderen Schwerpunkt auf der Molekularbiologie von Krebs und verwendet modernste Techniken des maschinellen Lernens und der Verarbeitung natürlicher Sprache, um Hinweise auf die Kennzeichen von Krebs im Text zu erkennen. Auswertungen des Systems haben die Fähigkeit, zu identifizieren unentdeckt Links unter Beweis gestellt und relevante Konzepte hoch unter dem potenziellen Verbindungen Rang.

Das System ist offen Daten gebaut unter Verwendung von, Open Source und offene Standards, und ist als interaktive Web-basierte Schnittstelle oder eine programmierbare API.

Die Forscher arbeiten derzeit den Umfang der LION-LBD auf den Ausbau weiterer Konzepte und Beziehungen schließen. Sie sind auch eng mit Krebsforscher arbeiten, um die Technologie für den Endanwender zu helfen und zu verbessern.

Das System wurde in Zusammenarbeit mit dem Language Technology Lab der University of Cambridge entwickelt, Cancer Research UK Cambridge Institute, und Karolinska Institutet in Schweden, und wurde vom Medical Research Council finanziert.

Quelle: www.technologynetworks.com