Aencertificial Intelligence System Accélère Recherche de découvertes sur le cancer

Recherche à travers les montagnes de publié recherche sur le cancer pourrait être facilité pour les scientifiques, grâce à un nouveau système d'intelligence artificielle. Le système, appelé LION LBD et développé par des informaticiens et des chercheurs sur le cancer à l'Université de Cambridge, a été conçu pour aider les scientifiques à la recherche de découvertes liées au cancer. Il est le premier système de découverte basée sur la littérature visant à soutenir la recherche sur le cancer. Les résultats sont présentés dans la revue Bio-informatique.

La recherche mondiale du cancer attire des quantités massives de financement dans le monde entier, et la littérature scientifique est si énorme que les chercheurs ont du mal à suivre avec elle: critique preuve génératrice d'hypothèses est maintenant souvent découvert longtemps après qu'il a été publié.

Le cancer est une classe complexe de maladies qui ne sont pas complètement compris et sont la deuxième cause principale de décès dans le monde. Le développement du cancer implique des changements dans de nombreuses molécules chimiques et biochimiques, réactions et voies, et la recherche sur le cancer est menée à travers une grande variété de domaines scientifiques, qui ont une variabilité dans la façon dont ils décrivent des concepts similaires.

“En tant que chercheur sur le cancer, même si tu savais ce que tu cherchais, il y a littéralement des milliers de journaux qui paraissent chaque jour,” a déclaré le professeur Anna Korhonen, Co-directeur du Language Technology Lab de Cambridge qui a dirigé le développement de LION LBD en collaboration avec le Dr Masashi Narita du Cancer Research UK Cambridge Institute et le professeur Ulla Stenius du Karolinska Institutet en Suède. “LION LBD utilise l'IA pour aider les scientifiques à se tenir au courant des découvertes publiées dans leur domaine, mais pourrait également les aider à faire de nouvelles découvertes en combinant ce qui est déjà connu dans la littérature en établissant des liens entre des sources qui peuvent sembler sans rapport.”

Le ‘LBD’ in LION LBD signifie Literature-Based Discovery, un concept développé dans les années 1980 qui cherche à faire de nouvelles découvertes en combinant des informations provenant de sources déconnectées. L'idée clé derrière la version originale de LBD est que des concepts qui ne sont jamais explicitement liés dans la littérature peuvent être indirectement liés par des concepts intermédiaires.

La conception du système LION LBD permet une recherche en temps réel pour découvrir des associations indirectes entre entités dans une base de données de dizaines de millions de publications tout en préservant la capacité des utilisateurs à explorer chaque mention dans son contexte d'origine.

“Par exemple, vous savez peut-être qu'un médicament anticancéreux affecte le comportement d'une certaine voie, mais avec LION LBD, vous pouvez constater qu'un médicament développé pour une maladie totalement différente affecte la même voie,” dit Korhonen.

LION LBD est le premier système développé spécifiquement pour les besoins de la recherche contre le cancer. Il se concentre particulièrement sur la biologie moléculaire du cancer et utilise des techniques d'apprentissage automatique et de traitement du langage naturel de pointe., afin de détecter les références aux caractéristiques du cancer dans le texte. Les évaluations du système ont démontré sa capacité à identifier les liens non découverts et à classer les concepts pertinents parmi les connexions potentielles..

Le système est construit à partir de données ouvertes, open source et normes ouvertes, et est disponible sous la forme d'une interface Web interactive ou d'une API programmable.

Les chercheurs travaillent actuellement à étendre la portée de LION-LBD pour inclure d'autres concepts et relations. Ils travaillent également en étroite collaboration avec des chercheurs sur le cancer pour aider et améliorer la technologie pour les utilisateurs finaux.

Le système a été développé en collaboration avec l'Université de Cambridge Language Technology Lab, Cancer Research UK Institute Cambridge, et l'Institut Karolinska en Suède, et a été financé par le Conseil de recherches médicales.

La source: www.technologynetworks.com